刚接手，企业是按核定征收方式交“印花税-购销合同”的，那当月印花税=（当月销售额+当月认证申报抵扣的不含税金额）*核定征收率*0.0003 ？

目前有几个数是已知的：“当月销售额”、“当月认证申报抵扣的不含税金额”、购销合同0.0003的税率、当月缴税金额及其计税金额。如果上面的计算方法没错的话，是不是用“计税金额”除以“当月销售额+当月认证申报抵扣的不含税金额”求核定征收率？可是很奇怪，我测算了二个月的印花税都和实缴数差了几块钱。而且算出来的核定征收率约58%左右。

楼主是在哪个省份？各省的征收方式是不完全相同的。如江西省还区分制造业、商业批发和商业零售三类，不同类别有不同的征收率。建议向当地税务机关咨询更稳妥些。

当月认证申报抵扣的不含税金额,是指进货的不含税的价格,并且是经过当月认证的吗?

我算出来了，原来是[销售额（含税）+进价额（含税）]*50%*0.003